Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC192P0DO97 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms