Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms