Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF888P0CJ79 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF888P0CJ79 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF888P0CJ79 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF888P0CJ79 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF888P0CJ79 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF888P0CJ79 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms