Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRCP08575 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRCP08575 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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