Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSP90AB1P08238 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HSP90AB1P08238 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms