Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CENPBP07199 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CENPBP07199 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CENPBP07199 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms