Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFNA4P05014 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms