Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C6orf47O95873 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C6orf47O95873 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C6orf47O95873 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C6orf47O95873 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms