Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATG7O95352 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATG7O95352 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATG7O95352 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATG7O95352 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATG7O95352 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms