Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCAF4O95104 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAF4O95104 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAF4O95104 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAF4O95104 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAF4O95104 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAF4O95104 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms