Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF3JO75822 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms