Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PITX3O75364 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PITX3O75364 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PITX3O75364 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms