Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIN3BO60391 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIN3BO60391 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms