Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms