Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL13O43927 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL13O43927 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms