Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A2O14975 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A2O14975 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms