Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APAF1O14727 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APAF1O14727 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APAF1O14727 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APAF1O14727 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms