Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELL2O00472 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELL2O00472 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELL2O00472 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms