Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NPIPA5E9PKD4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NPIPA5E9PKD4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms