Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP17L13C9JLJ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms