Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HMGB1P1B2RPK0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms