Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NOTOA8MTQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms