Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRT87PA6NCN2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms