Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPDC1A2A3K4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms