Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMED5Q9Y3A6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TMED5Q9Y3A6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMED5Q9Y3A6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms