Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SBNO2Q9Y2G9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SBNO2Q9Y2G9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SBNO2Q9Y2G9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SBNO2Q9Y2G9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SBNO2Q9Y2G9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SBNO2Q9Y2G9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms