Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMG5Q9UPR3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG5Q9UPR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG5Q9UPR3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG5Q9UPR3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms