Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ALKQ9UM73 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ALKQ9UM73 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ALKQ9UM73 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ALKQ9UM73 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
ALKQ9UM73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ALKQ9UM73 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ALKQ9UM73 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms