Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NRXN1Q9ULB1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NRXN1Q9ULB1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NRXN1Q9ULB1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NRXN1Q9ULB1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRXN1Q9ULB1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NRXN1Q9ULB1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms