Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3Q9UKS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PACSIN3Q9UKS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms