Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATPIF1Q9UII2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATPIF1Q9UII2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATPIF1Q9UII2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms