Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMPXQ9UHP9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMPXQ9UHP9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms