Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MLH3Q9UHC1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
MLH3Q9UHC1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MLH3Q9UHC1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
MLH3Q9UHC1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
MLH3Q9UHC1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
MLH3Q9UHC1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
MLH3Q9UHC1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms