Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DKK2Q9UBU2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DKK2Q9UBU2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DKK2Q9UBU2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DKK2Q9UBU2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms