Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNIH4Q9P003 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNIH4Q9P003 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNIH4Q9P003 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH4Q9P003 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH4Q9P003 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms