Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTMR4Q9NYA4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
MTMR4Q9NYA4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTMR4Q9NYA4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTMR4Q9NYA4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MTMR4Q9NYA4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MTMR4Q9NYA4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTMR4Q9NYA4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTMR4Q9NYA4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms