Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNTG2Q9NY99 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNTG2Q9NY99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNTG2Q9NY99 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNTG2Q9NY99 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNTG2Q9NY99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms