Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARVAQ9NVD7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARVAQ9NVD7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARVAQ9NVD7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms