Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACER3Q9NUN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACER3Q9NUN7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACER3Q9NUN7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms