Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPTBN5Q9NRC6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SPTBN5Q9NRC6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPTBN5Q9NRC6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTBN5Q9NRC6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTBN5Q9NRC6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms