Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TLR9Q9NR96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TLR9Q9NR96 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TLR9Q9NR96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TLR9Q9NR96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TLR9Q9NR96 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms