Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
XPNPEP3Q9NQH7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
XPNPEP3Q9NQH7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
XPNPEP3Q9NQH7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XPNPEP3Q9NQH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XPNPEP3Q9NQH7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XPNPEP3Q9NQH7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms