Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CRTAC1Q9NQ79 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRTAC1Q9NQ79 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRTAC1Q9NQ79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRTAC1Q9NQ79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms