Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NOP10Q9NPE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NOP10Q9NPE3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOP10Q9NPE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOP10Q9NPE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms