Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TREM1Q9NP99 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TREM1Q9NP99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TREM1Q9NP99 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TREM1Q9NP99 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms