Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM27Q9HBJ8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM27Q9HBJ8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM27Q9HBJ8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM27Q9HBJ8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms