Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYNCQ9H7C4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNCQ9H7C4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNCQ9H7C4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYNCQ9H7C4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNCQ9H7C4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms