Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIXL1Q9H2W2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MIXL1Q9H2W2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MIXL1Q9H2W2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MIXL1Q9H2W2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms