Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDT1Q9H211 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDT1Q9H211 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDT1Q9H211 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDT1Q9H211 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDT1Q9H211 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDT1Q9H211 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDT1Q9H211 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDT1Q9H211 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDT1Q9H211 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDT1Q9H211 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDT1Q9H211 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDT1Q9H211 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDT1Q9H211 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDT1Q9H211 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDT1Q9H211 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDT1Q9H211 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDT1Q9H211 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDT1Q9H211 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms