Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMG9Q9H0W8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMG9Q9H0W8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMG9Q9H0W8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMG9Q9H0W8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMG9Q9H0W8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
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